为贯彻落实党中央、国务院加强督查督办、狠抓工作落实的要求，税务总局制定了2017年系统督查工作计划，以税收征管体制改革、营改增、大众创业万众创新税收优惠政策落实等为重点，全年开展8次督查，实现对各省、自治区、直辖市和计划单列市国税局、地税局的全覆盖，确保各项税收改革落地生效。
目前，首次系统督查已全面完成，并取得明显成效。首次系统督查中，税务总局派出6个督查组，对北京、辽宁、湖北、广东、云南、陕西等6省市国税局、地税局就《深化国税、地税征管体制改革方案》实施情况开展了专项督查，重点督查实施《国税地税合作规范2.0版》、开展“便民办税春风行动”以及实施绩效管理等内容。督查采取明察暗访的方式，不仅到省局机关了解情况，更深入基层单位进行访谈，同时听取被督查单位工作汇报，查阅文件资料、分析信息系统数据，并举行税务干部座谈会、纳税人座谈会，全方位、多角度掌握改革落地和实施成效。据统计，本次督查共召开税务干部座谈会25次，纳税人座谈会12次，走访纳税人92户，走访办税服务厅和基层税务所43个，广泛征求意见建议。
首次督查聚焦突出问题，在督查中深入发现问题、督查后督促整改问题。此次督查共发现6省市税务机关落实工作中存在问题99个，共性问题18个。对督查发现的问题，及时向被督查单位反馈，要求制定整改方案，提出整改措施，明确责任人、时间表、路线图，4月底前完成整改。对督查发现的共性问题，要求各级税务机关对照自查，明确责任，举一反三，切实整改。税务总局专门建立督查台账，将各单位存在问题记录在册，实行对账销号。
税务总局办公厅有关负责人表示，3月中旬，按照中央全面深化改革领导小组办公室要求，税务总局进一步完善了督查工作方案，拟于今年上半年再开展两次督查，下半年根据改革落实情况再适时开展督查，争取年内实现对所有省（区、市）税务机关督查全覆盖。同时，将每次督查情况及各地整改情况纳入绩效管理，通过严督实考，确保落地见效。