相比营业税，增值税管理最大的特点就是不重复征税、环环相扣，税务机关利用金税工程系统，对增值税专用发票和企业增值税纳税状况严密监控，是 “ 以票控税 ” 的典型税种。从以往经验看，房地产业、建筑安装业、金融业和生活服务业均是发票问题最为突出的领域。因此，营改增后四大行业对增值税的管理应该更加规范，着力防范涉税行政和刑事法律风险。那么在实务操作层面，纳税人应该注意哪些问题呢？
抵扣凭证管理
营改增后，一般纳税人当期应纳增值税依据 “ 销项税额 - 进项税额 ” 计算得出。在销项税额既定的情况下，企业增值税税负取决于进项税额的大小。依据现行税法规定，纳税人取得的增值税扣税凭证不符合法律、行政法规或者国家税务总局有关规定的，其进项税额不得从销项税额中抵扣。增值税扣税凭证，是指增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品收购发票、农产品销售发票和税收缴款凭证。纳税人凭税收缴款凭证抵扣进项税额的，应当具备书面合同、付款证明和境外单位的对账单或者发票。资料不全的，其进项税额不得从销项税额中抵扣。因此， “ 三票一证 ” 的取得和管理，直接影响增值税税负，企业应该重视进项税额发票、凭证的管理。
规范财务核算
增值税税制下，对企业财务核算的规范性要求很高。现行税法规定，一般纳税人会计核算不健全，或者不能够提供准确税务资料的，企业应当按照销售额和增值税税率计算应纳税额，不得抵扣进项税额，也不得使用增值税专用发票。即如果一般纳税人企业税务核算不合规，会按照企业适用的增值税税率（ 17% 、 11% 和 6% ）直接计算当期应纳增值税。同时，现行税法规定，增值税纳税人提供适用不同税率或者征收率的应税服务，应当分别核算适用不同税率或者征收率的销售额；未分别核算的，从高适用税率。纳税人兼营免税、减税项目的，应当分别核算免税、减税项目的销售额；未分别核算的，不得免税和减税。因此，会计核算不是单纯的财务问题，也是税务管理的一个组成部分。增值税全面覆盖以后，企业不再需要对增值税和营业税分别核算，但应根据具体经营内容正确选择税目和适用税率，尤其在混合销售、混业经营等情况下，避免税收风险的发生。
防范虚开发票风险
目前，在刑事立法上，针对虚开增值税专用发票定罪量刑较为严厉。有统计显示， 70% 以上涉税犯罪的企业负责人，涉及虚开增值税专用发票。刑法第 205 条规定，对于触犯虚开增值税专用发票罪的单位判处罚金；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，处三年以下有期徒刑或者拘役；虚开的税款数额较大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑；虚开的税款数额巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑。因此，防范虚开增值税专用发票，要从 “ 受票 ” 和 “ 开票 ” 两个方面管控，做到不接收、不介绍、不开具，才能从根本上防范刑事风险的发生。
集团业务流程重塑
增值税比营业税的一大优势就是可以避免重复征税，有利于行业细分和专业化发展，提高生产效率。因此，企业集团可以通过外包部分服务，专注核心领域。例如营改增后，房地产建筑企业在选择委托或者是自营车辆运输时，可事先测算二者税负差异，对非独立核算的自营运输队车辆运输耗用的油料、配件及正常修理费用支出等项目按照 17% 的税率抵扣，对委托运输企业发生的运费按照 11% 的税率抵扣，企业集团可根据实际测算作出选择。此外，在业务流程节税筹划中，企业税务人员要在掌握税收政策的基础上，全面剖析自身商业模式和业务流程，以创新思维推动集团税收筹划。
合法开展税收筹划
对于企业而言，营改增的机遇与挑战并存，企业税收筹划空间扩大。具体而言，一是生活服务业的小企业可以按照经营规模，选择一般纳税人或小规模纳税人身份，适用不同的计税方式。二是营改增后，供给方的纳税人身份直接影响购货方的增值税税负。一般纳税人的企业更倾向选择同为一般纳税人的上游供应商，以合理获得增值税专用发票达到抵扣销项税款的目的。三是业务性质筹划。对于符合税收优惠政策要求的业务领域，应通过业务内容的筹划和优惠标准的满足，争取适用税收减免政策。四是科学筹划纳税时点，推迟缴纳税款，无异于获得了一笔无息贷款。由于增值税的纳税义务发生时间和交付结算方式有关。因此，企业可以通过筹划服务合同等方式推迟纳税义务的产生等。特别强调的是，对纳税人身份、业务流程、业务性质、核算方式和交付结算方式等的筹划，应在税法规定的合理范围内开展。
